Симаков М.Д., Корепов М.В., Кузьмин А.А., Титов С.В.
RJEE Vol. 6 (1). 2021 | DOI: 10.21685/2500-0578-2021-1-5
Аннотация | PDF (Rus) | Дополнительные файлы
Дата поступления 29.09.2020 | Дата опубликования 26.03.2021
УДК 598.2:575.22
ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ мтДНК В ПОВОЛЖСКОЙ ПОПУЛЯЦИИ ЧЕРНОГО КОРШУНА (MILVUS MIGRANS BODDAERT, 1783)
М. Д. Симаков1, М. В. Корепов2, А. А. Кузьмин3, С. В. Титов4
1, 4 Пензенский государственный университет, Россия, 440026, г. Пенза, ул. Красная, 40
2 Ульяновский государственный педагогический университет имени И. Н. Ульянова, Россия, 432071, г. Ульяновск, пл. Ленина, 4/5
3 Пензенский государственный технологический университет, Россия, 440039, г. Пенза, проезд Байдукова/ул. Гагарина, 1а/11
1 maksimakov@bk.ru, 2 korepov@list.ru, 3 kuzmin-puh@yandex.ru, 4 svtitov@yandex.ru
Аннотация. Актуальность и цели. Черный коршун (Milvus migrans Boddaert, 1783) является одним из распространенных видов дневных хищных птиц Поволжья. Коршун консервативен в выборе мест гнездования и использует одно и то же гнездо несколько лет подряд. Новые гнезда M. migrans строит редко. На территории Поволжья черный коршун образует устойчивые перелетные популяции, характеризующиеся, вследствие присущему виду гнездовому консерватизму, постоянством пространственного распределения особей. Этот вид дневных хищных птиц является удобной моделью для исследований популяционного полиморфизма. Целью работы было изучение полиморфизма поволжской популяции черного коршуна (M. migrans Bodd.) по данным анализа изменчивости контрольного региона (D-loop) митохондриальной ДНК. Материалы и методы. Материалом для работы послужил биоматериал, собранный неинвазивными методами в ходе полевых исследований 2017–2019 гг. поволжской популяции черного коршуна (M. migrans Bodd.). Всего собрано 47 образцов перьев, из 29 удалось выделить ДНК. Для генетического анализа образцов ДНК использовали фрагмент (357 пн) гипервариабельного контрольного региона (D-loop) мтДНК. Секвенирование фрагментов контрольного региона мтДНК (n = 25) проводили на секвенаторе ABI 3500 (Applied Biosystems). Гаплотипическое и нуклеотидное разнообразие было изучено с помощью программы DnaSP 5.10.01. Для реконструкции филогенетических отношений использовали методы максимального правдоподобия (ML) и ближайшего соседа (NJ) в программах MEGA X и MrBayes 3.2.7. Медианная сеть (Median Joining) митохондриальных гаплотипов была построена в программе PopART с использованием алгоритма TCS. Помимо полученных с территории Поволжья последовательностей были проанализированы 5 гаплотипов контрольного региона мтДНК M. migrans, характеризующих популяцию коршунов в южной Испании и 10 – M. milvus, описывающих полиморфизм красного коршуна в Европе, а также 2 гаплотипа подвида красного коршуна M. milvus fasciicauda. Для статистической обработки результатов для всех тестов был установлен уровень значимости p < 0.05. Результаты. Выявленное гаплотипическое разнообразие (h = 16) европейской популяции черного коршуна по контрольному региону мтДНК является широким по своему размаху (Hd = 0.924) и имеет некоторые региональные особенности (испанская популяция – h = 5, поволжская популяция – h = 14). По всей видимости, это разнообразие окажется еще большим при увеличении размеров выборки. Наибольший уровень средней эволюционной дивергенции (р, дистанция) по парам последовательностей был обнаружен в гаплогруппе европейского черного коршуна (Mmg) – 1.4±0.4 %. Оценка средней эволюционной дистанции между анализируемыми гаплогруппами показала, что она максимальна при сравнении гаплогруппы M. migrans с гаплогруппами M. milvus: Mmg/Mml – 2.9±0.9 %; Mmg/Mmf – 3.2±1.1 %. Результаты анализа среднего эволюционного разнообразия (p) выделенных гаплогрупп свидетельствуют о низком уровне их дифференциации. Заключение. Проведенный анализ дивергенции и разнообразия гаплотипов контрольного региона мтДНК не позволяет с высокой долей уверенности утверждать о существовании подразделенной генетической структуры ареала европейского черного коршуна, хотя наличие подразделенных генетических линий в нем очевидно. При расширении аналитической выборки, за счет охвата новых территорий ареала, вполне ожидаемо выявление структурированности области распространения M. migrans migrans.
Ключевые слова: Milvus migrans, контрольный регион, мтДНК, гаплотипическое разнообразие
Благодарности. Выражаем благодарность за предоставление некоторых образцов перьев черного коршуна Глушенкову Олегу Владимировичу, ведущему научному сотруднику Государственного природного заповедника «Присурский» и национального парка «Чаваш Вармане», и Кореповой Дарье Александровне, заведующему отделом природы Ульяновского областного краеведческого музея имени И. А. Гончарова.
Для цитирования: Симаков М. Д., Корепов М. В., Кузьмин А. А., Титов С. В. Генетическое разнообразие мтДНК в поволжской популяции черного коршуна (Milvus migrans Boddaert, 1783) // Russian Journal
of Ecosystem Ecology. 2021. Vol. 6 (1). https://doi.org/10.21685/2500-0578-2021-1-5