- Рис. 1. Популяции большого суслика, в которых был собран генетический материал для исследований: а – с. Чириково, Кузоватовский р-н, Ульяновская обл. (53.7472° с.ш., 47.8277° в.д.); б – о. Пальцинский (54.3905° с.ш., 48.4794° в.д.)
- Рис. 2. Результаты рестрикционного анализа мтДНК (D—loop) больших сусликов из: а – популяции у с. Чириково в 2005–2010 гг. (Ch1); б – популяции у c. Чириково в 2018–2019 гг. (Ch2). A, B2, C1, C1* – выявленные митотипы ДНК
- Рис. 3. Результаты генетического ML-анализа (модель HKY) нуклеотидных последовательностей (n = 32) участка D-петли мтДНК (1051 пн), показывающие филогенетические отношения между митотипами, характеризующими модельные популяции большого суслика. В узлах – результаты будстреп-анализа (1000 реплик), шкала – генетические дистанции между митотипами, К – контрольные последовательности. Популяции: 1 – с. Чириково в 2005–2010 гг. (Ch1); 2 – с. Чириково в 2018–2019 гг. (Ch2); 3 – о. Пальцинский, 2011 г. (Pal). Выявленные митотипы ДНК: GR 1 – B2, C1*; GR 2 – A; GR 3 – C1
- Рис. 4.Результаты генетического анализа нуклеотидных последовательностей (n = 32) участка мтДНК (D—loop, 1051 пн) больших сусликов – медианная сеть гаплотипов (Hap). Длина ветвей, соединяющих отдельныегаплотипы, пропорциональна количеству мутационных шагов (указаны цифрами). Ch1 – популяция с. Чириково в период 2005–2010 гг.,Ch2 – популяция с. Чириково в период 2018–2019 гг., Pal – популяция о. Пальцинский 2011 г.
- Рис. 5. Результаты генетического ML-анализа (модель TN93+G) нуклеотидных последовательностей (n = 44) гена CytbмтДНК (1140 пн), показывающие филогенетические отношения между гаплотипами, характеризующими модельные популяции большого суслика. В узлах – результаты будстреп-анализа (1000 реплик), шкала – генетические дистанции между митотипами, внешняя группа – Cytb европейского суслика (AF100720.1). Популяции: 1 – с. Чириково в 2005–2010 гг. (Ch1), 2 – с. Чириково в 2018–2019 гг. (Ch2), 3 – о. Пальцинский, 2011 г. (Pal). Выявленные гаплогруппымтДНК: GR 1, GR 2, GR 3
- Рис. 6.Результаты генетического анализа нуклеотидных последовательностей (n=44) гена Cytb (1140 пн) больших сусликов – медианная сеть гаплотипов (Hap). Длина ветвей, соединяющих отдельныегаплотипы, пропорциональна количеству мутационных шагов (указаны цифрами). Ch1 – популяция с. Чириково в период 2005–2010 гг.,Ch2 – популяция с. Чириково в период 2018–2019 гг., Pal – популяция о. Пальцинский 2011 г.
- Рис. 7. Сравнение показателей генетического разнообразия (p, К, h, Hd) (DnaSP) и дифференциации (T’s D, FST) (PopArt) популяции большого суслика с. Чириково в периоды 2005–2010 гг. (Ch1) и 2018–2019 гг. (Ch2) по двум маркерам мтДНК – D—loop, Cytb. Обозначения: p – нуклеотидное разнообразие, К – среднее число нуклеотидных различий (´102), h – число гаплотипов, Hd – гаплотипическое разнообразие, T’s D – тест Таджимы, FST – F-тест.
Copyright © 2016 RJEE. Сетевое издание зарегистрировано в Федеральной службе по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций. Свидетельство о регистрации Эл № ФС 77 - 62950 от 04 сентября 2015 г.